MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017785	TGCTAC	2	12	18	29	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386858703
2	NC_017785	TAC	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858703
3	NC_017785	TTC	2	6	51	56	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858703
4	NC_017785	TCC	2	6	78	83	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858703
5	NC_017785	TCC	2	6	108	113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858703
6	NC_017785	TCTT	2	8	127	134	0 %	75 %	0 %	25 %	386858703
7	NC_017785	CTT	2	6	159	164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858703
8	NC_017785	AT	3	6	272	277	50 %	50 %	0 %	0 %	386858703
9	NC_017785	CAA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858703
10	NC_017785	TACC	2	8	368	375	25 %	25 %	0 %	50 %	386858703
11	NC_017785	TTC	2	6	376	381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858703
12	NC_017785	TAG	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858703
13	NC_017785	CCA	2	6	541	546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858703
14	NC_017785	TCT	2	6	646	651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858703
15	NC_017785	CAC	2	6	874	879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858704
16	NC_017785	CAT	3	9	892	900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858704
17	NC_017785	TC	3	6	945	950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017785	TCT	2	6	999	1004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017785	ACA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017785	ATAC	2	8	1071	1078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017785	ACAT	2	8	1082	1089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017785	AATA	3	12	1090	1101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017785	ATA	3	9	1114	1122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017785	ATT	2	6	1224	1229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017785	TTG	2	6	1235	1240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017785	GCT	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017785	CTG	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017785	ATA	2	6	1285	1290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017785	N	696	696	1291	1986	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017785	TAG	2	6	2043	2048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017785	CTT	2	6	2061	2066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017785	AAT	2	6	2230	2235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017785	TTA	2	6	2240	2245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017785	ATCT	2	8	2298	2305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017785	TTC	2	6	2360	2365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017785	CAT	2	6	2509	2514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017785	TCTT	2	8	2538	2545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017785	TA	3	6	2547	2552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017785	ACT	2	6	2563	2568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017785	ATA	2	6	2578	2583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017785	TCT	2	6	2592	2597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017785	CT	4	8	2596	2603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017785	TA	4	8	2645	2652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017785	ACTT	2	8	2783	2790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017785	TAAT	2	8	2795	2802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017785	ATA	2	6	2901	2906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017785	CT	3	6	2931	2936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017785	TTA	2	6	2968	2973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017785	TATT	2	8	2979	2986	25 %	75 %	0 %	0 %	386858705
50	NC_017785	ACT	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858705
51	NC_017785	ATT	2	6	3099	3104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858705
52	NC_017785	GCA	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858705
53	NC_017785	CAG	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858705
54	NC_017785	ACC	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858705
55	NC_017785	TAG	2	6	3244	3249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858705
56	NC_017785	ATT	3	9	3260	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858705
57	NC_017785	AGC	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858705
58	NC_017785	GCA	2	6	3276	3281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858705

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.